మేము ఒక బహు కోణీయమైన పద్ధతిని అనుసరిస్తాము, దీనిలో సింగిల్-పార్టికల్ క్రైయో-ఇలక్ట్రాన్ మైక్రోస్కోపీ, ఎక్స్-రే క్రిస్టలోగ్రఫీ, ఎలక్ట్రోఫిజియాలజీ మరియు అనేక భౌతిక, రసాయనిక సాంకేతికతలు ఉన్నాయి. ఇవి iGluRs ఎలా పనిచేస్తున్నాయో మరియు వాటి సహాయక ప్రోటీన్ల ద్వారా ఎలా మోడ్యులేట్ చేయబడతాయో, తద్వారా సైనాప్టిక్ న్యూరోట్రాన్స్మిషన్ మరియు ప్లాస్టిసిటీపై ప్రభావం చూపిస్తున్నాయో అవగతం పొందడంలో సహాయపడతాయి.
సియస్ఐఆర్ - కణ మరియు అణు జీవవిజ్ఞాన కేంద్రం
ది ఇన్నోవేషన్ ఇంజిన్ ఆఫ్ ఇండియా
జనేష్ కుమార్
సీనియర్ ప్రిన్సిపల్ శాస్త్రవేత్త
కేంద్ర నాడీ వ్యవస్థలోని గ్లూటామేట్ రిసెప్టర్ సిగ్నలింగ్ కాంప్లెక్స్ల నిర్మాణం మరియు విధానాలపై పరిశోధనలు.
2588
janesh@ccmb.res.in
పరిశోధన ఆసక్తులు:
అయోనోట్రోపిక్ గ్లుటామేట్ గ్రాహకాలు (iGluRs) కేంద్ర నాడీ వ్యవస్థ (CNS)లో 60% ఉత్తేజకరమైన న్యూరోట్రాన్స్మిషన్కు మధ్యవర్తిత్వం వహిస్తాయి. అవి సకశేరుకాలలోని 18 జన్యువుల ద్వారా ఎన్కోడ్ చేయబడతాయి, ఇవి టెట్రామెరిక్ కేషన్ ఛానెల్లుగా నాలుగు గ్రూపులుగా విభిన్న క్రియాత్మక లక్షణాలతో సమావేశమవుతాయి, అవి; AMPA (?-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxalolepropionic acid), NMDA (N-methyl-D-aspartic acid), కైనేట్ మరియు డెల్టా కుటుంబాలు. వాటి పనిచేయకపోవడం ఆటిజం, మూర్ఛ, స్కిజోఫ్రెనియా, మానసిక రుగ్మతలు మరియు నొప్పి వంటి అనేక నాడీ సంబంధిత రుగ్మతలతో ముడిపడి ఉంది. మా బృందం ప్రధానంగా కైనేట్ మరియు డెల్టా గ్రాహక కుటుంబాలపై దృష్టి పెడుతుంది. ఒక వైపు, గ్రాహక అసెంబ్లీ, గేటింగ్ మరియు మాడ్యులేషన్ యొక్క పరమాణు అండర్పిన్నింగ్లను మేము విశదీకరించాలని భావిస్తున్నాము; మరోవైపు, స్థానిక, హెటెరోమెరిక్ గ్రాహకాలు మరియు వాటి సముదాయాల నిర్మాణాన్ని సహాయక ప్రోటీన్లతో అర్థంచేసుకోవడంలో మేము ఆసక్తి కలిగి ఉన్నాము.
ఎంచుకున్న ప్రచురణలు
ధింగ్రా S, చోపాడే PM, విన్నకోట R, కుమార్ J. గ్లూకే1 కైనేట్ రిసెప్టర్లలో ఎక్సాన్ 9 స్ప్లైస్ ఇన్సర్ట్ యొక్క ఫంక్షనల్ ఇంప్లికేషన్స్. eLife 2023 12: RP89755, https://doi.org/10.7554/eLife.89755.1
కుమార్ జె, పోపెస్కు జికె, గాంట్జ్ ఎస్సి. గ్లూడి గ్రాహకాలు క్రియాత్మక అయాన్ చానెల్స్. బయోఫిస్ జె. 2023 జూన్ 20;122(12):2383-2395. doi: 10.1016/j.bpj.2023.05.012.
విన్నకోట ఆర్, ధింగ్రా ఎస్, కుమారి జె, అన్సారీ ఎంవై, శుక్లా ఇ, నెర్కర్ ఎండి, కుమార్ జె. కైనేట్ గ్రాహకాల మాడ్యులేషన్లో నెటో1 ఎక్స్ట్రాసెల్యులార్ డొమైన్ పాత్ర. ఇంట్ జె బయోల్ మాక్రోమోల్. 2021 అక్టోబర్ 8;192:525-536. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2021.10.001.
జార్జ్ బి, అస్సయ్య ఎ, రాయ్ ఆర్జే, కెంభవి ఎ, చౌహాన్ ఆర్, పాల్ జి, కుమార్ జె*, నినాన్ ఎస్పీ*. CASSPER అనేది సింగిల్-పార్టికల్ క్రయో-ఎలక్ట్రాన్ మైక్రోస్కోపీ కోసం సెమాంటిక్ సెగ్మెంటేషన్-ఆధారిత పార్టికల్ పికింగ్ అల్గోరిథం. కమ్యూన్ బయోల్. 2021 ఫిబ్రవరి 15;4(1):200. doi:/10.1038/s42003-021-01721-1 (*సమాధానం చెప్పే రచయితలు)
కుమారి జె, బెంద్రే ఎడి, భోసలే ఎస్, విన్నకోట ఆర్, బురాడ ఎపి, ట్రియా జి, రావెల్లి ఆర్, పీటర్స్ పిజె, కుమార్ జె. క్రయో-ఇఎమ్ ద్వారా వెల్లడైన గ్లూకె3-కైనేట్ రిసెప్టర్ న్యూరోట్రాన్స్మిటర్ బైండింగ్ డొమైన్ల స్ట్రక్చరల్ డైనమిక్స్. ఇంట్ జె బయోల్ మాక్రోమోల్. 2020 ఏప్రిల్ 15; 149:1051–8.
అయానోట్రోపిక్ గ్లుటామేట్ రిసెప్టర్ GluD1 యొక్క క్రయో-EM నిర్మాణాలు మార్పిడి చేయని నిర్మాణాన్ని వెల్లడిస్తాయి. నాట్ స్ట్రక్ట్ మోల్ బయోల్. 2020 జనవరి;27(1):84-91. doi: 10.1038/s41594-019-0359-y.
విద్య మరియు అనుభవం
P.G:
M.Sc (బయోటెక్నాలజీ) ; దేవి అహల్య విశ్వవిద్యాలయం, ఇండోర్, మధ్యప్రదేశ్, భారతదేశం ; 1999-2001
Ph.D:
ఆల్ ఇండియా ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ మెడికల్ సైన్స్, న్యూఢిల్లీ, భారతదేశం; 2002-2007;
Post.Doc:
నేషనల్ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ చైల్డ్ హెల్త్ అండ్ హ్యూమన్ డెవలప్మెంట్ (NICHD), నేషనల్ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ హెల్త్ (NIH), బెథెస్డా, MD, USA; 2007-2013;
టీమ్ సభ్యులు
Janesh Kumar
Scientist-F
Sanjay Kumar Suman
Sr. Technical Officer(1)
Swathi P
Junior Research Fellow
Aswini Kumar Gupta
Junior Research Fellow
Shantanu S Visal
Junior Research Fellow (UGC)
Bhavya Kailash Dawath
Junior Research Fellow
Somanath Baral
Junior Research Fellow
Ithayaraja M
Principal Project Associate
Rajesh Vinnakota
Principal Project Associate
Mukund Sudharsan
SERB-NPDF
ప్రకాశనాలు
శీర్షిక
పత్రిక
సంవత్సరం
Functional Implications of the Exon 9 Splice Insert in GluK1 Kainate Receptors
bioRxiv
2023
GluD receptors are functional ion channels
Biophys J
2023
Structure, Function, and Regulation of the Kainate Receptor
Subcell Biochem.
2022
Ionotropic glutamate delta receptors: The enigma has finally begun to unravel
Neuropharmacology
2022
Role of Neto1 extracellular domain in modulation of kainate receptors.
Int J Biol Macromol
2021
Structural biology of ionotropic glutamate delta receptors and their crosstalk with metabotropic glutamate receptors
Neuropharmacology
2021
An overview of the recent advances in cryo-electron microscopy for life sciences
Emerg Top Life Sci.
2021
CASSPER is a semantic segmentation-based particle picking algorithm for single-particle cryo-electron microscopy
Commun Biol.
2021
Emerging insights into the structure and function of ionotropic glutamate delta receptors
Br J Pharmacol
2020
The architecture of GluD2 ionotropic delta glutamate receptor elucidated by cryo-EM
J Struct Biol.
2020
Structural dynamics of the GluK3-kainate receptor neurotransmitter binding domains revealed by cryo-EM
Int J Biol Macromol.
2020
Cryo-EM structures of the ionotropic glutamate receptor GluD1 reveal a non-swapped architecture
Nat Struct Mol Biol.
2020
Structural and Functional Insights into GluK3-kainate Receptor Desensitization and Recovery
Sci Rep.
2019
Self-assembled monolayers improve protein distribution on holey carbon cryo-EM supports
Sci Rep
2014
Structural mechanism of glutamate receptor activation and desensitization.
Nature
2014
Functional insights from glutamate receptor ion channel structures.
Annu Rev Physiol.
2013
Zinc potentiates GluK3 glutamate receptor function by stabilizing the ligand binding domain dimer interface.
Neuron
2012
Structure and assembly mechanism for heteromeric kainate receptors.
Neuron
2011
A highly conserved protein of unknown function in Sinorhizobium meliloti affects sRNA regulation similar to Hfq.
Nucleic Acids Res.
2011
Crystal structures of the glutamate receptor ion channel GluK3 and GluK5 amino-terminal domains
J Mol Biol
2010
Domain organization and function in GluK2 subtype kainate receptors
Proc Natl Acad Sci U S A.
2010
The N-terminal domain of GluR6-subtype glutamate receptor ion channels.
Nat Struct Mol Biol.
2009
The N-terminal domain of GluR6-subtype glutamate receptor ion channels.
Nat Struct Mol Biol.
2009
The N-terminal domain of GluR6-subtype glutamate receptor ion channels.
Nat Struct Mol Biol.
2009
Domain organization and function in GluK2 subtype kainate receptors
Proc Natl Acad Sci U S A.
2010
Domain organization and function in GluK2 subtype kainate receptors
Proc Natl Acad Sci U S A.
2010
Crystal structures of the glutamate receptor ion channel GluK3 and GluK5 amino-terminal domains
J Mol Biol
2010
Crystal structures of the glutamate receptor ion channel GluK3 and GluK5 amino-terminal domains
J Mol Biol
2010
A highly conserved protein of unknown function in Sinorhizobium meliloti affects sRNA regulation similar to Hfq.
Nucleic Acids Res.
2011
A highly conserved protein of unknown function in Sinorhizobium meliloti affects sRNA regulation similar to Hfq.
Nucleic Acids Res.
2011
Structure and assembly mechanism for heteromeric kainate receptors.
Neuron
2011
Structure and assembly mechanism for heteromeric kainate receptors.
Neuron
2011
Zinc potentiates GluK3 glutamate receptor function by stabilizing the ligand binding domain dimer interface.
Neuron
2012
Zinc potentiates GluK3 glutamate receptor function by stabilizing the ligand binding domain dimer interface.
Neuron
2012
Zinc potentiates GluK3 glutamate receptor function by stabilizing the ligand binding domain dimer interface.
Neuron
2012
Functional insights from glutamate receptor ion channel structures.
Annu Rev Physiol.
2013
Functional insights from glutamate receptor ion channel structures.
Annu Rev Physiol.
2013
Structural mechanism of glutamate receptor activation and desensitization.
Nature
2014
Structural mechanism of glutamate receptor activation and desensitization.
Nature
2014
Self-assembled monolayers improve protein distribution on holey carbon cryo-EM supports
Sci Rep
2014
Self-assembled monolayers improve protein distribution on holey carbon cryo-EM supports
Sci Rep
2014
Structural and Functional Insights into GluK3-kainate Receptor Desensitization and Recovery
Sci Rep.
2019
Structural and Functional Insights into GluK3-kainate Receptor Desensitization and Recovery
Sci Rep.
2019
Cryo-EM structures of the ionotropic glutamate receptor GluD1 reveal a non-swapped architecture
Nat Struct Mol Biol.
2020
Cryo-EM structures of the ionotropic glutamate receptor GluD1 reveal a non-swapped architecture
Nat Struct Mol Biol.
2020
Structural dynamics of the GluK3-kainate receptor neurotransmitter binding domains revealed by cryo-EM
Int J Biol Macromol.
2020
Structural dynamics of the GluK3-kainate receptor neurotransmitter binding domains revealed by cryo-EM
Int J Biol Macromol.
2020
The architecture of GluD2 ionotropic delta glutamate receptor elucidated by cryo-EM
J Struct Biol.
2020
The architecture of GluD2 ionotropic delta glutamate receptor elucidated by cryo-EM
J Struct Biol.
2020
Emerging insights into the structure and function of ionotropic glutamate delta receptors
Br J Pharmacol
2020
Emerging insights into the structure and function of ionotropic glutamate delta receptors
Br J Pharmacol
2020
CASSPER is a semantic segmentation-based particle picking algorithm for single-particle cryo-electron microscopy
Commun Biol.
2021
CASSPER is a semantic segmentation-based particle picking algorithm for single-particle cryo-electron microscopy
Commun Biol.
2021
An overview of the recent advances in cryo-electron microscopy for life sciences
Emerg Top Life Sci.
2021
An overview of the recent advances in cryo-electron microscopy for life sciences
Emerg Top Life Sci.
2021
Structural biology of ionotropic glutamate delta receptors and their crosstalk with metabotropic glutamate receptors
Neuropharmacology
2021
Structural biology of ionotropic glutamate delta receptors and their crosstalk with metabotropic glutamate receptors
Neuropharmacology
2021
Role of Neto1 extracellular domain in modulation of kainate receptors.
Int J Biol Macromol
2021
Role of Neto1 extracellular domain in modulation of kainate receptors.
Int J Biol Macromol
2021
Ionotropic glutamate delta receptors: The enigma has finally begun to unravel
Neuropharmacology
2022
Ionotropic glutamate delta receptors: The enigma has finally begun to unravel
Neuropharmacology
2022
Structure, Function, and Regulation of the Kainate Receptor
Subcell Biochem.
2022
Structure, Function, and Regulation of the Kainate Receptor
Subcell Biochem.
2022
GluD receptors are functional ion channels
Biophys J
2023
GluD receptors are functional ion channels
Biophys J
2023
Functional Implications of the Exon 9 Splice Insert in GluK1 Kainate Receptors
bioRxiv
2023
Functional Implications of the Exon 9 Splice Insert in GluK1 Kainate Receptors
bioRxiv
2023