సియస్ఐఆర్ - కణ మరియు అణు జీవవిజ్ఞాన కేంద్రం
ది ఇన్నోవేషన్ ఇంజిన్ ఆఫ్ ఇండియా
సుమన్ ఎస్. ఠాకూర్
ప్రిన్సిపల్ శాస్త్రవేత్త
2865
sst[at]ccmb[dot]res[dot]in
పరిశోధన ఆసక్తులు:
క్యాన్సర్ అత్యంత క్లిష్టమైన మరియు ప్రాణాంతక వ్యాధులలో ఒకటి. మానవ శరీరంలో క్యాన్సర్ ప్రారంభం ఎలా జరుగుతుందో మా ప్రయోగశాల అర్థం చేసుకోవాలనుకుంటోంది. ముఖ్యంగా, క్యాన్సర్ ప్రారంభం యొక్క యాంత్రిక వివరాలు మరియు ప్రక్రియ ఇంకా బాగా అర్థం కాలేదు. బాల్యం మరియు దూకుడు క్యాన్సర్లకు మెటాస్టాసిస్తో సహా క్యాన్సర్ల ప్రారంభం మరియు క్యాన్సర్ అభివృద్ధిలో వాటి పురోగతిని అర్థం చేసుకోవడం మా పరిశోధన ఆసక్తులలో ఉంటుంది. కణ జీవశాస్త్రం, మౌస్ నమూనాలు మరియు మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ ఆధారిత పరిమాణాత్మక మరియు లక్ష్య ప్రోటీమిక్స్తో సహా ఆధునిక జీవశాస్త్ర విధానాలను ఉపయోగించి క్యాన్సర్ అణచివేత జన్యువుల నష్టం మరియు క్యాన్సర్ ప్రారంభంలో పోస్ట్-ట్రాన్స్లేషనల్ సవరణల ప్రమేయాన్ని పరిశోధించడంలో మేము ప్రత్యేకంగా ఆసక్తి కలిగి ఉన్నాము. ఇంకా, బాల్యం మరియు దూకుడు క్యాన్సర్ల కోసం క్యాన్సర్ ప్రారంభం మరియు పురోగతిలో పాల్గొన్న బయోమార్కర్లు క్యాన్సర్ చికిత్సా విధానాలను అభివృద్ధి చేయడానికి లక్ష్యంగా పనిచేస్తాయి.
ఎంచుకున్న ప్రచురణలు:
చటర్జీ బి, ఠాకూర్ ఎస్ఎస్. 2018. సింగిల్-రన్ మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ విశ్లేషణ E. coli ప్రోటియోమ్పై లోతైన అవగాహనను అందిస్తుంది. జర్నల్ ఆఫ్ ది అమెరికన్ సొసైటీ ఫర్ మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ, 29(12): 2394–2401. doi: 10.1007/s13361-018-2066-z.
(ఈ పరిశోధన పత్రంలోని ముఖ్యాంశాలు నేచర్ ఇండియాలో ప్రచురించబడ్డాయి.)
కల్లమాడి పి.ఆర్, దండు కె, కీర్తి పి.బి, రావు సి.ఎం, ఠాకూర్ ఎస్ఎస్, ముల్పురి ఎస్. 2018. పౌడరీ మిల్డ్యూ-సంఖ్యాకిత, ససెప్టిబుల్, రెసిస్టెంట్ మరియు ఇమ్యూన్ సన్ఫ్లవర్ జనోటైప్స్పై లోతైన అవగాహన. ప్రోటియోమిక్స్, జూన్ 19:e1700418. doi: 10.1002/pmic.201700418.
(ఈ పత్రం ఫ్రంట్ కవర్ పేజ్ కోసం ఎంపిక చేయబడింది మరియు దీని ముఖ్యాంశాలు నేచర్ ఇండియాలో ప్రచురించబడ్డాయి.)
వర్ధిష్ణ ఎం.వి, శ్రీనివాసులు జి, హరికృష్ణ ఎ, ఠాకూర్ ఎస్ఎస్, చటర్జీ బి. 2019. అచైరల్ ట్రైపెప్టైడ్స్ నుండి స్వీయ-సంయోజిత నానోస్ఫియర్లు మరియు నానోఫైబర్లు ఏకకాలంలో ఏర్పడటం. కెమిస్ట్రీ ఓపెన్, 8(3): 266–270. https://doi.org/10.1002/open.201800258.
(ఈ పత్రం కవర్ ఫీచర్ కోసం ఎంపిక చేయబడింది.)
సేహగల్ ఎన్, గుప్తా ఎ, వల్లి ఆర్కె, జోషి ఎస్డీ, మిల్స్ జెటి, హామెల్ ఇ, ఖన్నా పి, జైన్ ఎస్సి, ఠాకూర్ ఎస్ఎస్, రవీంద్రనాథ్ వి. 2012. విథానియా సోమ్నిఫెరా కాలేయంలో తక్కువ సాంద్రత గల లైపోప్రోటీన్ రిసెప్టర్-సంబంధిత ప్రోటీన్ స్థాయిని పెంచడం ద్వారా ఆల్జీమర్స్ వ్యాధి రుగ్మతలను తిరిగి సాధారణ స్థితికి తీసుకువస్తుంది. ప్రోసీడింగ్స్ ఆఫ్ ది నేషనల్ అకాడమీ ఆఫ్ సైన్సెస్, USA, 109(9): 3510–3515. doi: 10.1073/pnas.1112209109.
ఠాకూర్ ఎస్ఎస్, గీగర్ టి, చటర్జీ బి, బాండిల్లా పి, ఫ్రోలిచ్ ఎఫ్, కాక్ జె, మాన్ ఎం. 2011. ప్రీ-ఫ్రాక్షనేషన్ అవసరం లేకుండా LC-MS/MS ద్వారా లోతైన మరియు అత్యంత సున్నితమైన ప్రోటియోమ్ కవరేజ్. మాలిక్యులర్ సెల్ ప్రోటియోమిక్స్, 10(8): M110.003699. doi: 10.1074/mcp.M110.003699.
(2011 ఆగస్టు నెలలో మోలిక్యులర్ సెల్ ప్రోటియోమిక్స్లో అత్యధికంగా చదవబడిన వ్యాసం.)
విద్య మరియు అనుభవం
P.G:
1998 ; రాంచీ విశ్వవిద్యాలయం రాంచీ ;
Ph.D:
ఢిల్లీ విశ్వవిద్యాలయం, ఢిల్లీ ; 2002 ;
Post.Doc:
వాల్టర్ రీడ్ ఆర్మీ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ రీసెర్చ్, సిల్వర్ స్ప్రింగ్, మేరీల్యాండ్, MD, USA; 2002-2004;
ఇండియన్ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ సైన్స్, బెంగళూరు, భారతదేశం; 2005-2009;
మాక్స్ ప్లాంక్ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ బయోకెమిస్ట్రీ, మ్యూనిచ్, జర్మనీ; 2009-2011;
టీమ్ సభ్యులు
Suman S. Thakur
Scientist-E
ప్రకాశనాలు
శీర్షిక
పత్రిక
సంవత్సరం
Valuable Contributions and Lessons Learned from Proteomics and Metabolomics Studies of COVID-19
J Proteome Research
2024
Cancer stem cell research: A phosphoproteomic approach
Elsevier, Academic Press
2023
Proteins and Metabolites fingerprints of Gestational Diabetes Mellitus forming Protein-Metabolite Interactomes are its potential biomarkers
Proteomics
2023
Diverse vaccine platforms safeguarding against SARS-CoV-2 and its variants,
Expert Rev Vaccines
2022
SARS-CoV-2 Infection Triggers Phosphorylation: Potential Target for Anti-COVID-19 Therapeutics
Front Immunol
2022
An insight into major signaling pathways and protein-protein interaction networks involved in the pathogenesis of gestational diabetes mellitus
Proteomics
2022
Remdesivir and its combination with repurposed drugs as COVID-19 therapeutics
Front Immunol
2022
Editorial: Proteomics and Its Applications in Cancer
Front. Oncol
2021
Ageing of Hematopoietic Stem Cells: Insight into Mechanisms and Consequences
Elsevier, Academic Press
2021
Proteomics and its application in endocrine disorders
Biochim Biophys Acta Proteins Proteom,
2021
Proteomics and Its Application in Pandemic Diseases.
J Proteome Res
2020
ACE2 as a potential therapeutic target for pandemic COVID-19
RSC Adv.
2020
Simultaneous Occurrence of Nanospheres and Nanofibers Self-Assembled from Achiral Tripeptides
Chemistry Open
2019
Drug Repurposing for Retinoblastoma: Recent Advances
Curr Top Med Chem
2019
Achievements in cancer research and its therapeutics in hundred years
Curr Top Med Chem
2019
Studies on the DNA binding and anticancer activity of Ru(II) polypyridyl complexes by using a (2-(4-(diethoxymethyl)-1H-imidazo[4,5-f][1,10] phenanthroline)) intercalative ligand
New J. Chem
2018
Comparison of Nuclear Matrix and Mitotic Chromosome Scaffold proteins in Drosophila S2 cells - Transmission of hallmarks of nuclear organization through mitosis.
Mol Cell Proteomics
2018
Absence of?Wdr13?Gene Predisposes Mice to Mild Social Isolation - Chronic Stress, Leading to Depression-Like Phenotype Associated With Differential Expression of Synaptic Proteins.
Front Mol Neurosci
2018
An Insight into Powdery Mildew-Infected, Susceptible, Resistant, and Immune Sunflower Genotypes.
Proteomics
2018
Investigation of post-translational modifications in type 2 diabetes
Clinical Proteomics
2018
Single-run mass spectrometry analysis provides deep insight into E. coli proteome
J Am Soc Mass Spectrom
2018
Extracellular region of epidermal growth factor receptor: a potential target for anti-EGFR drug discovery
Oncogene
2017
Human PRE-PIK3C2B, an intronic cis-element with dual function of activation and repression,
Biochimica et BiophysicaActa (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms
2017
Withaniasomniferahas potential to treat cancer
Springer Press
2017
Proteomics in India: A Report on Brainstorming Meeting at Hyderabad, India
Mol Cell Proteomics
2016
Identification of components of the SUMOylation machinery in Candida glabrata: role of the deSUMOylation peptidase CgUlp2 in virulence
J Biol Chem
2016
Implication of Genetic Deletion of Wdr13 in Mice: Mild Anxiety, Better Performance in Spatial Memory Task, With Upregulation of Multiple Synaptic Proteins
Front. Mol. Neurosci
2016
Withania somnifera Root Extract has Potent Cytotoxic Effect against Human Malignant Melanoma Cells
PLoS ONE
2015
Lipopeptides from the Banyan Endophyte, Bacillus subtilis K1: Mass Spectrometric Characterization of a Library of Fengycins
J Am Soc Mass Spectrom
2012
Withani asomnifera reverses Alzheimer\\\'s disease pathology by enhancing low-density lipoprotein receptor-related protein in liver.
Proc. Natl. Acad. Sci. U S A
2012
Mechanism of growth inhibition of intraerythrocytic stages of Plasmodium falciparum by 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleoside (AICAR).
Mol. Biochem. Parasitol
2011
Deep and highly sensitive proteome coverage by LC-MS/MS without pre-fractionation.
Mol Cell Proteomics
2011
Detection of the protein dimers, multiple monomeric states and hydrated forms of Plasmodium falciparum triosephosphate isomerase in the gas phase
Protein Eng Des Sel
2009
Characterization of Alkali Induced Formation of Lanthionine, Trisulfides and Tetasulfides from Peptide Disulfides using Positive and Negative Ion Mass Spectrometry
J Am Soc Mass Spectrom
2009
Identification of alpha- and beta-hydroxy acid containing cyclodepsipeptides in natural peptide mixtures using negative ion mass spectrometry.
J Am Soc Mass Spectrom
2009
Role of 16S ribosomal RNA methylations in translation initiation in Escherichia coli.
EMBO J
2008
Fragmentation of peptide disulfides under conditions of negative ion mass spectrometry: studies of oxidized glutathione and contryphan.
J Am Soc Mass Spectrom
2008
Rapid mass spectral identification of contryphans. Detection of characteristic peptide ions by fragmentation of intact disulfide-bonded peptides in crude venom
Rapid Commun Mass Spectrom
2007
De novo sequencing and disulfide mapping of a bromotryptophan-containing conotoxin by Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry
Anal Chem
2006
Hypothalamic protein profiling from mice subjected to social defeat stress
Molecular Brain
2024
Interaction networks among miRNA, protein, and metabolite fingerprints identify the regulatory networks and key players in the pathogenesis of diabetic cardiomyopathy
Frontiers in Cell and Developmental Biology
2025
Proteomic and Metabolomic Data Transparency
Journal of Proteome Research
2025
Proteomic and Metabolomic Data Transparency
Journal of Proteome Research
2025
Proteomic and Metabolomic Data Transparency
Journal of Proteome Research
2025
Interaction networks among miRNA, protein, and metabolite fingerprints identify the regulatory networks and key players in the pathogenesis of diabetic cardiomyopathy
Frontiers in Cell and Developmental Biology
2025
Interaction networks among miRNA, protein, and metabolite fingerprints identify the regulatory networks and key players in the pathogenesis of diabetic cardiomyopathy
Frontiers in Cell and Developmental Biology
2025