సియస్ఐఆర్ - కణ మరియు అణు జీవవిజ్ఞాన కేంద్రం
ది ఇన్నోవేషన్ ఇంజిన్ ఆఫ్ ఇండియా
శ్రీరామ్ వరహన్
సీనియర్ శాస్త్రవేత్త
కణ జీవక్రియ, సూక్ష్మజీవుల జన్యుశాస్త్రం మరియు సూక్ష్మజీవుల వ్యాధికారకత
2531
sriram[at]ccmb[dot]res[dot]in
పరిశోధన ఆసక్తులు:
సూక్ష్మజీవులు వాటి సహజ వాతావరణంలో మరియు హోస్ట్ వాతావరణంలో సంక్రమణ సమయంలో ఎదుర్కొనే అత్యంత సాధారణ సవాళ్లలో పోషక లభ్యతలో హెచ్చుతగ్గులు ఒకటి. ఈ సవాలుకు ప్రతిస్పందనగా, సూక్ష్మజీవులు ఈ డైనమిక్ వాతావరణాలలో మనుగడ సాగించడానికి మరియు కొనసాగడానికి అనుమతించే ప్రత్యేక కణ స్థితులకు తిరోగమనంగా మారుతాయి. సూక్ష్మజీవుల సమాజ అభివృద్ధి మరియు హోస్ట్ పాథోజెనిసిస్ సందర్భంలో ప్రత్యేకంగా సంరక్షించబడిన జీవక్రియ సంఘటనలు ఈ కణ స్థితి పరివర్తనలను ఎలా నిర్దేశిస్తాయో అర్థం చేసుకోవడం మా బృందం లక్ష్యం. మేము బేకర్ \\\\\\\ యొక్క ఈస్ట్ అలాగే వ్యాధికారక శిలీంధ్ర నమూనాలు (ప్రధానంగా క్రిప్టోకోకస్ నియోఫార్మన్స్) వంటి సాధారణ శిలీంధ్ర నమూనాలను ఉపయోగిస్తాము మరియు ఈ ప్రశ్నలను పరిష్కరించడానికి సూక్ష్మజీవుల జన్యుశాస్త్రం, జీవరసాయన మరియు కణ-జీవశాస్త్ర ఆధారిత విధానాలను మైక్రోస్కోపీ, ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్స్, సంబంధిత మాస్-స్పెక్ట్రోమెట్రీ మరియు సెల్ కల్చర్/జంతు సంక్రమణ నమూనాలతో కలిపి బహుళ విభాగ విధానాలను ఉపయోగిస్తాము.
ఎంచుకున్న ప్రచురణలు
శ్రీరామ్ వరాహన్* మరియు సునీల్ లక్ష్మణ్*. (2021). వంపు లేదా విచ్ఛిన్నం: క్లోనల్ సూక్ష్మజీవుల సంఘాలలో జీవరసాయనపరంగా బహుముఖ అణువులు జీవక్రియ విభజనను ఎలా సాధ్యం చేస్తాయి. జన్యుశాస్త్రం అక్టోబర్ 2;219(2):iyab109. doi: 10.1093/genetics/iyab109. (* సహ-సంబంధిత రచయితలు)
శ్రీరామ్ వరాహన్, వైభవ్ సిన్హా, ఆదిష్ వాల్వేకర్, సందీప్ కృష్ణ మరియు సునీల్ లక్ష్మణ్. (2020). వనరు-ప్లాస్టిసిటీ ఆధారిత కార్బన్-నైట్రోజన్ వనరుల బడ్జెట్ క్లోనల్ కమ్యూనిటీలో ప్రత్యేకత మరియు శ్రమ విభజనను అనుమతిస్తుంది. eLife సెప్టెంబర్ 2;9:e57609. doi: 10.7554/eLife.57609.
శ్రీరామ్ వరాహన్, ఆదిష్ వాల్వేకర్, వైభవ్ సిన్హా, సందీప్ కృష్ణ మరియు సునీల్ లక్ష్మణ్. (2019). జీవక్రియ పరిమితులు ప్రత్యేక కణ సమూహాల స్వీయ-వ్యవస్థను నడిపిస్తాయి. eLife జూన్ 26;8:e46735. doi: 10.7554/eLife.46735.
శ్రీరామ్ వరాహన్, నాథన్ హార్మ్స్, జాన్ టోమిచ్, మైఖేల్ గిల్మోర్ మరియు లిన్ హాన్కాక్. (2014). ఎంటరోకోకస్ ఫెకాలిస్లో పెప్టైడ్ సెక్స్ ఫెరోమోన్ల స్రావం కోసం ABC ట్రాన్స్పోర్టర్ అవసరం. mBio. 5(5):e01726-14. doi:10.1128/mBio.01726-14.
శ్రీరామ్ వరాహన్, విజయలక్ష్మి అయ్యర్, విలియం మూర్ మరియు లిన్ హాన్కాక్. (2013). ఈఈపీ ఈసీఎఫ్ సిగ్మా ఫ్యాక్టర్, సిగ్వి యాక్టివేషన్ ద్వారా ఎంటరోకోకస్ ఫెకాలిస్కు లైసోజైమ్ నిరోధకతను అందిస్తుంది. జర్నల్ ఆఫ్ బాక్టీరియాలజీ. జూలై;195(14):3125-34. doi:10.1128/JB.00291-13.
విద్య మరియు అనుభవం
P.G:
బి-టెక్. బయోటెక్నాలజీ; అన్నా విశ్వవిద్యాలయం; 2010
Ph.D:
కణ-కణ సంభాషణ మరియు ఒత్తిడి అనుసరణలో ఎంటరోకోకల్ మెంబ్రేన్ ప్రోటీన్ల పాత్ర; కాన్సాస్ విశ్వవిద్యాలయం, USA; 2014
Post.Doc:
ఇన్స్టిట్యూట్ ఫర్ స్టెమ్ సెల్ సైన్స్ అండ్ రీజెనరేటివ్ మెడిసిన్ (ఇన్స్టెమ్), బెంగళూరు, భారతదేశం; 2015-2021;
టీమ్ సభ్యులు
Sriram Varahan
Scientist-D
T Avinash Raj
Senior Technical Officer(2)
Purushotham V
Sr. Technical Officer(1)
Shamanthula Santhosh Kumar
Technician (1)
Yogita Martoliya
Post-Doctoral Fellow
Dhrumi Miteshkumar Shah
Senior Research Fellow (UGC)
Pallavi Phatak
Junior Research Fellow
Siddhi Gupta
Junior Research Fellow
Kumari Uma Mahto
Research Associate-I (DBT)
Sudharsan M
Research Associate-I (DBT)
Nikita Rewatkar
Project Associate-I
Ishvarya Suresh
Project Associate -I
Sayantani Biswas
Project Associate-I
Sooraj Vasanthan
Project Associate-I
Mary Shejo
Project Associate-I
ప్రకాశనాలు
శీర్షిక
పత్రిక
సంవత్సరం
Unity in Diversity: Interkingdom Polymicrobial Biofilms in Disease
Multispecies Biofilms: Technologically Advanced Methods to Study Microbial Communities
2023
Bend or break: how biochemically versatile molecules enable metabolic division of labor in clonal microbial communities
Genetics. 219(2):iyab109. doi: 10.1093/genetics/iyab109.
2021
SigV mediates lysozyme resistance in Enterococcus faecalis via RsiV and PgdA
Journal of Bacteriology. 203(20):e0025821. doi: 10.1128/JB.00258-21.
2021
Influence of the alternate sigma factor RpoN on global gene expression and carbon catabolism in Enterococcus faecalis V583
mBio. 12(3):e00380-21. doi: 10.1128/mBio.00380-21.
2021
Resource plasticity driven carbon-nitrogen budgeting enables specialization and division of labor in a clonal community
Elife. Sep 2;9:e57609. doi: 10.7554/eLife.57609.
2020
Involvement of chromosomally encoded homologs of the RRNPP protein family in Enterococcus faecalis biofilm formation and UTI pathogenesis
Journal of Bacteriology. Aug 10;202(17):e00063-20. doi: 10.1128/JB.00063-20.
2020
Large-scale testing using Tapestry pooling
medRxiv. doi: https://doi.org/10.1101/2020.10.09.20209742.
2020
Tapestry: A Single-Round Smart Pooling Technique for COVID-19 Testing
medRxiv. doi:https://doi.org/10. 1101/ 2020.04.23.20077727.
2020
Metabolic constraints drive self-organization of specialized cell groups
Elife. Jun 26;8. pii: e46735. doi: 10.7554/eLife.46735.
2019
To defend or not to defend: That?s the question
mSphere. 1(3):e00127-16. doi:10.1128/mSphere.00127-16.
2016
Pheromone killing of multidrug resistant Enterococcus faecalis strain V583 by commensal strains
Proc Natl Acad Sci U S A. Jun 9;112(23):7273-8.
2015
An ABC transporter is required for secretion of peptide sex pheromones in Enterococcus faecalis
mBio. 5(5):e01726-14. doi:10.1128/mBio.01726-14.
2014
Drosophila host model reveals new Enterococcus faecalis quorum-sensing associated virulence factors
PLoS ONE. May;8(5):e64740.doi:10.1371/journal.pone.0064740.
2013
Eep confers lysozyme resistance to Enterococcus faecalis via the activation of the ECF sigma factor, SigV
Journal of Bacteriology. Jul;195(14):3125-34. doi:10.1128/JB.00291-13.
2013
The deubiquitinase Ubp3/Usp10 constrains glucose-mediated mitochondrial repression via phosphate budgeting
Elife. Sep 26:12:RP90293. doi: 10.7554/eLife.90293.
2024
Enterococcus faecalis
Trends in Microbiology. 32(9):925-926. doi: 10.1016/j.tim.2024.04.010.
2024
Humoral Innate Immune Response and Disease
Clinical Immunology. Aug;144(2):142-58. doi: 10.1016/j.clim.2012.06.002.
2012
Humoral Innate Immune Response and Disease
Clinical Immunology. Aug;144(2):142-58. doi: 10.1016/j.clim.2012.06.002.
2012
Humoral Innate Immune Response and Disease
Clinical Immunology. Aug;144(2):142-58. doi: 10.1016/j.clim.2012.06.002.
2012
Enterococcus faecalis
Trends in Microbiology. 32(9):925-926. doi: 10.1016/j.tim.2024.04.010.
2024
Enterococcus faecalis
Trends in Microbiology. 32(9):925-926. doi: 10.1016/j.tim.2024.04.010.
2024
The deubiquitinase Ubp3/Usp10 constrains glucose-mediated mitochondrial repression via phosphate budgeting
Elife. Sep 26:12:RP90293. doi: 10.7554/eLife.90293.
2024
The deubiquitinase Ubp3/Usp10 constrains glucose-mediated mitochondrial repression via phosphate budgeting
Elife. Sep 26:12:RP90293. doi: 10.7554/eLife.90293.
2024