సియస్ఐఆర్ - కణ మరియు అణు జీవవిజ్ఞాన కేంద్రం
ది ఇన్నోవేషన్ ఇంజిన్ ఆఫ్ ఇండియా
వెంకట్ ఆర్ చలంచర్ల
సీనియర్ శాస్త్రవేత్త
ట్రాన్స్క్రిప్షన్ మరియు క్రోమాటిన్ నియంత్రణ
2526
cvraditya@ccmb.res.in
పరిశోధన ఆసక్తులు
జన్యు వ్యక్తీకరణ యొక్క ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ నియంత్రణ అనుకూల సూక్ష్మజీవుల ఒత్తిడి ప్రతిస్పందనలకు చాలా ముఖ్యమైనది మరియు బహుళ సెల్యులార్ జీవుల అభివృద్ధికి ప్రాథమికమైన కణ స్థితి పరివర్తనలను నియంత్రిస్తుంది. ట్రాన్స్క్రిప్షన్ యొక్క తప్పు నియంత్రణ మానవులలో క్యాన్సర్తో సహా అనేక జన్యు రుగ్మతలతో ముడిపడి ఉంది. ట్రాన్స్క్రిప్షన్ సమయంలో RNA పాలిమరేస్ II (Pol II) కదలిక RNA ప్రాసెసింగ్ కారకాలు మరియు క్రోమాటిన్ నియంత్రకాలచే యూకారియోటిక్ కణాలలో జన్యు ఉత్పత్తి మరియు జన్యు ఐసోఫామ్లను నిర్ణయించే మార్గాల్లో ప్రభావితమవుతుంది; అయితే, అంతర్లీన విధానాలు ఇప్పటికీ సరిగా అర్థం కాలేదు. అత్యంత సంరక్షించబడిన 5`-3` ఎక్సోరిబోన్యూక్లీస్ Xrn2 ద్వారా Pol II పాజ్ చేయడం మరియు తదుపరి ట్రాన్స్క్రిప్షన్ ముగింపును నియంత్రించడానికి పర్యావరణ సంకేతాలు ఎలా సమగ్రపరచబడ్డాయో నిర్వచించడం మా పరిశోధన లక్ష్యం. ఈ ప్రయోజనం కోసం, మేము ఒక సాధారణ ఈస్ట్ మోడల్ వ్యవస్థను మరియు జన్యుశాస్త్రం, జన్యుశాస్త్రం, ప్రోటీన్ బయోకెమిస్ట్రీ మరియు సెల్ బయాలజీని కలిగి ఉన్న బహుళ విభాగ విధానాన్ని ఉపయోగిస్తాము.
ఎంచుకున్న ప్రచురణలు
ఫోల్కో HD et al., (2017) \\”ఏపుగా ఉండే కణాలలో గేమెటోజెనిక్ జన్యువుల అకాల వ్యక్తీకరణ యూనిపేరెంటల్ డిసోమీకి కారణమవుతుంది\\\” నేచర్ 543(7643):126-130.
సుగియామా టి మరియు ఇతరులు, (2016) \\”మెయోటిక్ mRNA క్షయం మరియు ఫ్యాకల్టేటివ్ హెటెరోక్రోమాటిన్ అసెంబ్లీని ప్రోత్సహించడానికి Mmi1 మరియు సంరక్షించబడిన RNA ప్రాసెసింగ్ కారకాలతో మూలాధార సహకారాన్ని పెంపొందించేవారు\\\” మోల్. సెల్ 61(5):747-59.
చలంచర్ల VR et al., (2015) \\\”ఒక సంరక్షించబడిన కారకం Dhp1/Rat1/Xrn2 అకాల ట్రాన్స్క్రిప్షన్ ముగింపును ప్రేరేపిస్తుంది మరియు జన్యు నిశ్శబ్దాన్ని ప్రోత్సహించడానికి హెటెరోక్రోమాటిన్ను న్యూక్లియేట్ చేస్తుంది\\\” PNAS 112(51):15548-55.
లీ ఎన్ మరియు ఇతరులు, (2013) \\”హెటెరోక్రోమాటిన్ అసెంబ్లీ మరియు టెలోమీర్ నిర్వహణ కోసం Mtr4-వంటి ప్రోటీన్ న్యూక్లియర్ RNA ప్రాసెసింగ్ను సమన్వయం చేస్తుంది\\\” సెల్ 155(5):1061-74.
చలంచర్ల VR మరియు ఇతరులు, (2010) \\”గ్రూప్ II ఇంట్రాన్ యొక్క న్యూక్లియర్ వ్యక్తీకరణ స్ప్లైసోసోమల్ ఇంట్రాన్ వంశపారంపర్యంగా ఉంటుంది\\” జీన్స్ డెవ్. 24(8):827-836.
విద్య మరియు అనుభవం
P.G:
బయోటెక్నాలజీ; ఆంధ్ర విశ్వవిద్యాలయం; 2003
Ph.D:
హెటెరోలాగస్ హోస్ట్లలో గ్రూప్ II ఇంట్రాన్ డైనమిక్స్; స్టేట్ యూనివర్శిటీ ఆఫ్ న్యూయార్క్, యూనివర్శిటీ ఎట్ అల్బానీ, USA; 2010
Post.Doc:
క్రోమాటిన్ బయాలజీ; నేషనల్ క్యాన్సర్ ఇన్స్టిట్యూట్ (NCI/NIH), USA; 2011-2016
ఆర్ఎన్ఏ బయాలజీ; వాడ్స్వర్త్ సెంటర్, యుఎస్ఎ; 2010-2011
టీమ్ సభ్యులు
Venkat R Chalamcharla
Scientist-D
Anubhav Bhardwaj
Sr. Technical Officer (2)
Annapoorna K P
Senior Research Fellow
Sauvik Das Naskar
Junior Research Fellow
Alluri Vaishanv Verma
Junior Research Fellow
Ankur Paul
Junior Research Fellow
Kabila Nagaraj
Junior Research Fellow (Project)
Yemula Sahithi
Project Associate - I
ప్రకాశనాలు
శీర్షిక
పత్రిక
సంవత్సరం
Untimely expression of gametogenic genes in vegetative cells causes uniparental disomy
Nature
2017
Enhancer of Rudimentary Cooperates with Conserved RNA-Processing Factors to Promote Meiotic mRNA Decay and Facultative Heterochromatin Assembly
Molecular Cell
2016
Conserved factor Dhp1/Rat1/Xrn2 triggers premature transcription termination and nucleates heterochromatin to promote gene silencing
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2015
RNA-RNA interactions and pre-mRNA mislocalization as drivers of group II intron loss from nuclear genomes
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2014
Mtr4-like protein coordinates nuclear RNA processing for heterochromatin assembly and for telomere maintenance
Cell
2013
Learning to live together: mutualism between self-splicing introns and their hosts.
BMC Biology
2011
Nuclear expression of a group II intron is consistent with spliceosomal intron ancestry
Genes and Development
2010
Global regulators orchestrate group II intron retromobility
Molecular Cell
2009
A mutant screen reveals RNase E as a silencer of group II intron retromobility in Escherichia coli
RNA
2008
Bipolar localization of the group II intron Ll.LtrB is maintained in Escherichia coli deficient in nucleoid condensation, chromosome partitioning and DNA replication
Molecular Microbiology
2006
Bipolar localization of the group II intron Ll.LtrB is maintained in Escherichia coli deficient in nucleoid condensation, chromosome partitioning and DNA replication
Molecular Microbiology
2006
Bipolar localization of the group II intron Ll.LtrB is maintained in Escherichia coli deficient in nucleoid condensation, chromosome partitioning and DNA replication
Molecular Microbiology
2006
A mutant screen reveals RNase E as a silencer of group II intron retromobility in Escherichia coli
RNA
2008
A mutant screen reveals RNase E as a silencer of group II intron retromobility in Escherichia coli
RNA
2008
Global regulators orchestrate group II intron retromobility
Molecular Cell
2009
Global regulators orchestrate group II intron retromobility
Molecular Cell
2009
Nuclear expression of a group II intron is consistent with spliceosomal intron ancestry
Genes and Development
2010
Nuclear expression of a group II intron is consistent with spliceosomal intron ancestry
Genes and Development
2010
Learning to live together: mutualism between self-splicing introns and their hosts.
BMC Biology
2011
Learning to live together: mutualism between self-splicing introns and their hosts.
BMC Biology
2011
Mtr4-like protein coordinates nuclear RNA processing for heterochromatin assembly and for telomere maintenance
Cell
2013
Mtr4-like protein coordinates nuclear RNA processing for heterochromatin assembly and for telomere maintenance
Cell
2013
RNA-RNA interactions and pre-mRNA mislocalization as drivers of group II intron loss from nuclear genomes
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2014
RNA-RNA interactions and pre-mRNA mislocalization as drivers of group II intron loss from nuclear genomes
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2014
Conserved factor Dhp1/Rat1/Xrn2 triggers premature transcription termination and nucleates heterochromatin to promote gene silencing
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2015
Conserved factor Dhp1/Rat1/Xrn2 triggers premature transcription termination and nucleates heterochromatin to promote gene silencing
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2015
Enhancer of Rudimentary Cooperates with Conserved RNA-Processing Factors to Promote Meiotic mRNA Decay and Facultative Heterochromatin Assembly
Molecular Cell
2016
Enhancer of Rudimentary Cooperates with Conserved RNA-Processing Factors to Promote Meiotic mRNA Decay and Facultative Heterochromatin Assembly
Molecular Cell
2016
Untimely expression of gametogenic genes in vegetative cells causes uniparental disomy
Nature
2017
Untimely expression of gametogenic genes in vegetative cells causes uniparental disomy
Nature
2017