शोध रुचियाँ

कोशिकाओं के भीतर उपस्थित डीएनए, जिसे मिलाकर जीनोम कहा जाता है, वह निर्देश पुस्तिका है जिसे कोशिका की मशीनरी पढ़ती है ताकि वह जीवित रह सके और कार्य कर सके। मेरा प्रयोगशाला इस बात को समझने में रुचि रखती है कि कैसे भारतीयों के जीनोम में विविधता उन्हें स्वास्थ्य और रोगों में भिन्नताओं के लिए प्रवृत्त करती है। हम इसे दो स्तरों पर अध्ययन करते हैं।

पहले, हम उन्नत हाई-थ्रूपुट सीक्वेंसिंग तकनीकों का उपयोग करके व्यक्तियों में आनुवंशिक विविधता की पहचान करते हैं। बड़े राष्ट्रीय जनसंख्या जीनोमिक्स कार्यक्रमों के हिस्से के रूप में, हम स्वस्थ जीनोमों में प्राकृतिक विविधता का मानचित्रण करते हैं। विशेष रूप से, हमारी रुचि दो प्रकार की विविधताओं में है, जिन्हें संरचनात्मक विविधताएँ और टेंडम रिपीट्स के रूप में जाना जाता है।

हम यह भी अध्ययन करते हैं कि एक ही डीएनए अनुक्रम कैसे विभिन्न गुणसूत्रों को उत्पन्न कर सकता है, जैसा कि एक ही जीव के विभिन्न कोशिका प्रकारों में देखा जाता है। एक समान जीनोम होने के बावजूद, कोशिकाएँ एपिजेनेटिक तंत्रों के माध्यम से भिन्न रूप से नियंत्रित हो सकती हैं, जो कोशिका-विशिष्ट जीन अभिव्यक्ति पैटर्न का परिणाम देती हैं। सिंगल-सेल जीनोमिक तकनीकों का उपयोग करके, हम विभिन्न कोशिकाओं के जीन अभिव्यक्ति और एपिजेनेटिक प्रोफाइल का विश्लेषण करते हैं ताकि कोशिका की विषमताओं को समझा जा सके।

अंत में, हम नई कम्प्यूटेशनल विधियाँ विकसित करते हैं जो जटिल जैविक डेटा के तेज़ और बेहतर विश्लेषण को सक्षम बनाती हैं, साथ ही साथ अधिक इंटरएक्टिव और सहज डेटा विज़ुअलाइजेशन भी प्रदान करती हैं।

चयनित प्रकाशन

पाठक ए.के., मिश्रा जी.पी., उप्पिली बी., वालिया एस., फतिही एस., अब्बास टी., बानू एस., घोष ए., कणामपल्लीवार ए., झा ए., फातिमा एस., अग्रवाल एस., धर एम.एस., मारवाल आर., राधाकृष्णन वी.एस., पोनुसामी के., काबरा एस., रक्षीत पी., भोयार आर.सी., जैन ए., दीवाकर एम.के., इमरान एम., फरूक एम., सोवपाती डी.टी., ठाकुरल एल., राघव एस.के., मुखर्जी एम. (2022)। SARS-CoV-2 जीनोम में अंदर-होस्ट भिन्नता की स्पैटियो-टेम्पोरल डायनेमिक्स। न्यूक्लिक ऐसिड्स रिसर्च, 22 फरवरी 2022; 50(3): 1551-1561। doi: 10.1093/nar/gkab1297।

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सिंह एन.के., श्रीवास्तव एस., जावरी एल., बिंगी टी.सी., मेसिपोगू आर., कुमार वी.एस., गौर एन., हजीर्निस एन., मच्छा पी., शंभवी एस., खान एस., सौजन्‍य एम., नागबंदी टी., मिश्रा आर.के., तल्लापका के.बी., सोवपाती डी.टी. (2021)। COVID-19 रोगियों में SARS-CoV-2 संक्रमण के प्रति मेज़बान ट्रांस्क्रिप्शनल प्रतिक्रिया। क्लिनिकल ट्रांसलेशनल मेडिसिन। सितम्बर 2021;11(9):e534। doi: 10.1002/ctm2.534।

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