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सीएसआईआर - कोशिकीय एवं आणविक जीवविज्ञान केन्द्र

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वेंकट आर चलमचरला

वेंकट आर चलमचरला

वेंकट आर चलमचरला

वरिष्ठ वैज्ञानिक
ट्रांसक्रिप्शन एंड क्रोमेटिन रेगुलेशन
2526
cvraditya@ccmb.res.in

शोध में रुचि

जीन अभिव्यक्ति का प्रतिलेखन नियंत्रण अनुकूली सूक्ष्मजीवी तनाव प्रतिक्रियाओं के लिए महत्वपूर्ण है और कोशिका अवस्था संक्रमणों को नियंत्रित करता है जो बहुकोशिकीय जीवों के विकास के लिए मौलिक हैं। प्रतिलेखन का गलत विनियमन मनुष्यों में कैंसर सहित कई आनुवंशिक विकारों से जुड़ा है। प्रतिलेखन के दौरान आरएनए पॉलीमरेज़ II (Pol II) की गति आरएनए प्रसंस्करण कारकों और क्रोमैटिन नियामकों द्वारा इस तरह प्रभावित होती है जो यूकेरियोटिक कोशिकाओं में जीन आउटपुट और जीन आइसोफॉर्म निर्धारित करती है; हालाँकि, अंतर्निहित तंत्र अभी भी पूरी तरह से समझ में नहीं आया है। हमारा शोध यह परिभाषित करना चाहता है कि पर्यावरणीय संकेतों को Pol II विराम और एक अत्यधिक संरक्षित 5`-3` एक्सोरिबोन्यूक्लिऐज Xrn2 द्वारा परिणामी प्रतिलेखन समाप्ति को विनियमित करने के लिए कैसे एकीकृत किया जाता है। इस उद्देश्य के लिए, हम एक सरल यीस्ट मॉडल प्रणाली और एक बहु-विषयक दृष्टिकोण का उपयोग करते हैं जिसमें आनुवंशिकी, जीनोमिक्स, प्रोटीन जैव रसायन और कोशिका जीव विज्ञान शामिल हैं।

चयनित प्रकाशन

फोल्को एचडी एट अल., (2017) \\\”वनस्पति कोशिकाओं में गैमेटोजेनिक जीन की असामयिक अभिव्यक्ति यूनिपैरेंटल डिसोमी का कारण बनती है\\\” नेचर 543(7643):126-130.

सुगियामा टी एट अल., (2016) \\”अल्पविकसित प्रवर्धक एमएमआई1 और संरक्षित आरएनए प्रसंस्करण कारकों के साथ मिलकर अर्धसूत्रीविभाजन mRNA क्षय और वैकल्पिक हेटरोक्रोमैटिन संयोजन को बढ़ावा देता है।” मोल. सेल 61(5):747-59.

चालमचार्ला वी.आर. एट अल., (2015) \\\”एक संरक्षित कारक Dhp1/Rat1/Xrn2 समयपूर्व प्रतिलेखन समाप्ति को ट्रिगर करता है और जीन साइलेंसिंग को बढ़ावा देने के लिए हेटरोक्रोमैटिन को न्यूक्लियेट करता है\\\” PNAS 112(51):15548-55.

ली एन एट अल., (2013) \\\”एमटीआर4-जैसा प्रोटीन हेटरोक्रोमैटिन असेंबली और टेलोमेर रखरखाव के लिए परमाणु आरएनए प्रसंस्करण का समन्वय करता है\\\” सेल 155(5):1061-74.

चालमचार्ला वी.आर. एट अल., (2010) \\\”ग्रुप II इंट्रॉन की नाभिकीय अभिव्यक्ति स्प्लिसोसोमल इंट्रॉन वंशावली के अनुरूप है\\\” जीन डेव. 24(8):827-836.

शिक्षा और अनुभव

स्नातकोत्तर:

जैव प्रौद्योगिकी; आंध्र विश्वविद्यालय; 2003

Ph.D:

विषम मेजबानों में समूह II इंट्रोन गतिशीलता; स्टेट यूनिवर्सिटी ऑफ़ न्यूयॉर्क, यूनिवर्सिटी एट अल्बानी, यूएसए; 2010

पोस्ट डॉक्टरेट:

क्रोमेटिन बायोलॉजी; राष्ट्रीय कैंसर संस्थान (एनसीआई/एनआईएच), यूएसए; 2011-2016

आरएनए जीवविज्ञान; वड्सवर्थ सेंटर, यूएसए; 2010-2011

टीम सदस्य

team-members-pic
Venkat R Chalamcharla
Venkat R Chalamcharla

Scientist-D

Scientist-D

Anubhav Bhardwaj
Anubhav Bhardwaj

Sr. Technical Officer (2)

Sr. Technical Officer (2)

Annapoorna K P
Annapoorna K P

Senior Research Fellow

Senior Research Fellow

Sauvik Das Naskar
Sauvik Das Naskar

Junior Research Fellow

Junior Research Fellow

Alluri Vaishanv Verma
Alluri Vaishanv Verma

Junior Research Fellow

Junior Research Fellow

Ankur Paul
Ankur Paul

Junior Research Fellow

Junior Research Fellow

Kabila Nagaraj
Kabila Nagaraj

Junior Research Fellow (Project)

Junior Research Fellow (Project)

Yemula Sahithi
Yemula Sahithi

Project Associate - I

Project Associate - I

प्रकाशन

शीर्षक

पत्रिका

वर्ष

Untimely expression of gametogenic genes in vegetative cells causes uniparental disomy
Nature
2017
Enhancer of Rudimentary Cooperates with Conserved RNA-Processing Factors to Promote Meiotic mRNA Decay and Facultative Heterochromatin Assembly
Molecular Cell
2016
Conserved factor Dhp1/Rat1/Xrn2 triggers premature transcription termination and nucleates heterochromatin to promote gene silencing
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2015
RNA-RNA interactions and pre-mRNA mislocalization as drivers of group II intron loss from nuclear genomes
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2014
Mtr4-like protein coordinates nuclear RNA processing for heterochromatin assembly and for telomere maintenance
Cell
2013
Learning to live together: mutualism between self-splicing introns and their hosts.
BMC Biology
2011
Nuclear expression of a group II intron is consistent with spliceosomal intron ancestry
Genes and Development
2010
Global regulators orchestrate group II intron retromobility
Molecular Cell
2009
A mutant screen reveals RNase E as a silencer of group II intron retromobility in Escherichia coli
RNA
2008
Bipolar localization of the group II intron Ll.LtrB is maintained in Escherichia coli deficient in nucleoid condensation, chromosome partitioning and DNA replication
Molecular Microbiology
2006
Bipolar localization of the group II intron Ll.LtrB is maintained in Escherichia coli deficient in nucleoid condensation, chromosome partitioning and DNA replication
Molecular Microbiology
2006
Bipolar localization of the group II intron Ll.LtrB is maintained in Escherichia coli deficient in nucleoid condensation, chromosome partitioning and DNA replication
Molecular Microbiology
2006
A mutant screen reveals RNase E as a silencer of group II intron retromobility in Escherichia coli
RNA
2008
A mutant screen reveals RNase E as a silencer of group II intron retromobility in Escherichia coli
RNA
2008
Global regulators orchestrate group II intron retromobility
Molecular Cell
2009
Global regulators orchestrate group II intron retromobility
Molecular Cell
2009
Nuclear expression of a group II intron is consistent with spliceosomal intron ancestry
Genes and Development
2010
Nuclear expression of a group II intron is consistent with spliceosomal intron ancestry
Genes and Development
2010
Learning to live together: mutualism between self-splicing introns and their hosts.
BMC Biology
2011
Learning to live together: mutualism between self-splicing introns and their hosts.
BMC Biology
2011
Mtr4-like protein coordinates nuclear RNA processing for heterochromatin assembly and for telomere maintenance
Cell
2013
Mtr4-like protein coordinates nuclear RNA processing for heterochromatin assembly and for telomere maintenance
Cell
2013
RNA-RNA interactions and pre-mRNA mislocalization as drivers of group II intron loss from nuclear genomes
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2014
RNA-RNA interactions and pre-mRNA mislocalization as drivers of group II intron loss from nuclear genomes
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2014
Conserved factor Dhp1/Rat1/Xrn2 triggers premature transcription termination and nucleates heterochromatin to promote gene silencing
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2015
Conserved factor Dhp1/Rat1/Xrn2 triggers premature transcription termination and nucleates heterochromatin to promote gene silencing
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2015
Enhancer of Rudimentary Cooperates with Conserved RNA-Processing Factors to Promote Meiotic mRNA Decay and Facultative Heterochromatin Assembly
Molecular Cell
2016
Enhancer of Rudimentary Cooperates with Conserved RNA-Processing Factors to Promote Meiotic mRNA Decay and Facultative Heterochromatin Assembly
Molecular Cell
2016
Untimely expression of gametogenic genes in vegetative cells causes uniparental disomy
Nature
2017
Untimely expression of gametogenic genes in vegetative cells causes uniparental disomy
Nature
2017

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