CCMB

సియస్ఐఆర్ - కణ మరియు అణు జీవవిజ్ఞాన కేంద్రం

ది ఇన్నోవేషన్ ఇంజిన్ ఆఫ్ ఇండియా

×

స్వయంచాలక DNA సీక్వెన్సింగ్

ఈ సదుపాయంలో ఫ్లోరసెంట్ లేబుల్ చేయబడిన DNA అణువులను విశ్లేషించడానికి, అమెరికా సంస్థ Applied Biosystems తయారు చేసిన రెండు ఆటోమేటెడ్ కాపిలరీ అరే ఆధారిత DNA సీక్వెన్సర్లు (మోడల్ 3730) ఉన్నాయి. ఈ సంవత్సరం, అధిక సామర్థ్య (హై థ్రూపుట్) అప్లికేషన్‌ల కోసం మరో DNA సీక్వెన్సర్ (మోడల్ 3730xl) కూడా సదుపాయంలో చేర్చబడింది.

ఈ సిస్టమ్స్ 96/48 కాపిలరీ అరేల సాయంతో ఒకేసారి 96/48 నమూనాలను సీక్వెన్స్ చేయగలవు. సీక్వెన్సింగ్ మరియు జీనోటైపింగ్ రెండూ ఒకే కాపిలరీ అరేలో నిర్వహించవచ్చు. అన్ని మోడల్స్‌లో ఆర్గాన్ అయాన్ లేజర్ ఎగ్జిటేషన్ సోర్స్, మరియు ఒకేసారి ఐదు ఫ్లోరసెంట్ డైలను గుర్తించగల CCD కెమెరా ఉంటుంది. రోబోటిక్ వ్యవస్థల సాయంతో 96/384 వెల్ ప్లేట్ల నుండి నమూనాలు ఆటోమేటిక్‌గా 96/48 కాపిలరీల అరేలో లోడ్ అవుతాయి. రోజుకు సుమారు 2300 సీక్వెన్సింగ్ నమూనాలను 24 గంటల్లో ప్రాసెస్ చేయవచ్చు, ప్రతి నమూనా సగటు రీడ్ లెంగ్త్ సుమారు 700 బేస్‌లు. ఫ్రాగ్మెంట్ విశ్లేషణ అప్లికేషన్‌ల కోసం థ్రూపుట్ రోజుకు సుమారు 38,000 జీనోటైప్స్. 36 & 50 సెం.మీ. పొడవు గల కాపిలరీ అరేలు 500 bp నుండి 800 bp వరకు రీడ్ లెంగ్త్‌ను అందిస్తాయి. ఇంటిగ్రేటెడ్ ఆటో సాంప్లర్, సాంపిల్ ప్లేట్ స్టాకర్ మరియు బార్‌కోడ్ రీడర్ వంటి ఫీచర్లు పూర్తిగా ఆటోమేషన్ మరియు సులభమైన నమూనా ట్రాకింగ్ సౌకర్యాన్ని అందిస్తాయి.

కాపిలరీలో గుర్తింపు (in-capillary detection), డ్యూయల్ సైడ్ ఇల్యూమినేషన్ మరియు బ్యాక్‌సైడ్ థిన్నడ్ CCD వంటి లక్షణాలు సమాన సిగ్నల్ మరియు అధిక ఆప్టికల్ సెన్సిటివిటీని అందిస్తూ ఖచ్చితమైన మరియు తక్కువ ఖర్చుతో DNA ఫ్రాగ్మెంట్ విశ్లేషణకు సహాయపడతాయి. ఈ సదుపాయంలో Sequence Analysis, Genotyper, SeqScape, Auto Assembler వంటి సాఫ్ట్‌వేర్‌లు కూడా అందుబాటులో ఉన్నాయి.

అదనంగా, ఈ సదుపాయంలో అనేక IBM మరియు Macintosh కంప్యూటర్లు నెట్‌వర్క్ చేయబడి ఉన్నాయి, వీటి ద్వారా డేటా విశ్లేషణ చేయబడుతుంది. ఈ సిస్టమ్స్‌లో అన్ని సాఫ్ట్‌వేర్‌ల లైసెన్స్ వెర్షన్లు అందుబాటులో ఉన్నాయి మరియు డేటా డౌన్‌లోడ్ మరియు విశ్లేషణ కోసం కంట్రోల్ కంప్యూటర్లకు నెట్‌వర్క్ చేయబడి ఉన్నాయి.

ఏదైనా సేవలు లేదా సదుపాయం వినియోగానికి సంబంధించి, దయచేసి ఈ చిరునామాకు రాయండి: bdg[at]ccmb[dot]res[dot]in

resource-img

This will close in 0 seconds

Skip to content