यह सुविधा फ्लोरोसेंटली लेबल वाले DNA अणुओं के विश्लेषण के लिए मैसर्स एप्लाइड बायोसिस्टम्स (Applied Biosystems), यूएसए के दो ऑटोमेटेड कैपिलरी एरे-आधारित DNA सीक्वेंसर्स (मॉडल 3730) से सुसज्जित है। इस वर्ष, हाई-थ्रूपुट अनुप्रयोगों के लिए इस सुविधा को एक अन्य DNA सीक्वेंसर (मॉडल 3730xl) के साथ अपडेट किया गया था।

ये सिस्टम 96/48 कैपिलरी एरे का उपयोग करके एक साथ 96/48 नमूनों की सीक्वेंसिंग करने में सक्षम हैं। एक ही कैपिलरी एरे में सीक्वेंसिंग और जीनोटाइपिंग दोनों कार्य किए जा सकते हैं। सभी मॉडलों में एक आर्गन आयन लेज़र प्रेरक ऊर्जा का स्रोत (excitation source) और एक साथ पांच फ्लोरोसेंट रंगों का पता लगाने के लिए एक CCD कैमरा है। 96/384 वेल प्लेट्स (well plates) से नमूनों को रोबोटिक्स का उपयोग करके 96/48 कैपिलरी के एरे पर स्वचालित रूप से लोड किया जाता है। 700 बेस की औसत रीड लेंथ के साथ 24 घंटे में 2300 से ज़्यादा सीक्वेंसिंग सैंपल संसाधित किए जा सकते हैं। फ्रैगमेंट विश्लेषण अनुप्रयोगों के लिए थ्रूपुट लगभग 38,000 जीनोटाइप प्रति दिन है। कैपिलरी एरे के विभिन्न आकार यानी 36 और 50 सेमी, 500 bp से 800 bp तक की रीड लेंथ देते हैं। एकीकृत बिल्ट-इन ऑटो सैंपलर, सैंपल प्लेट स्टैकर और बार कोड रीडर पूर्ण स्वचालन और नमूनों की निगरानी करने की आसान प्रक्रिया है।

इन-कैपिलरी डिटेक्शन, डुअल साइड इल्यूमिनेशन और बैकसाइड थिन्ड CCD जैसी खूबियों से एक समान सिग्नल और उच्च ऑप्टिकल सूक्ष्मग्राहिता प्रदान करती हैं, जिसके परिणामस्वरूप DNA खंडों का सटीक और किफ़ायती विश्लेषण होता है। इस सुविधा में सीक्वेंस एनालिसिस, जीनोटाइपर, सीकस्केप (SeqScape), ऑटो असेंबलर आदि सॉफ्टवेयर भी उपलब्ध हैं।
इस सुविधा में डाउनस्ट्रीम डेटा विश्लेषण के लिए एक साथ नेटवर्क से जुड़े कई IBM और मैकिन्टोश (Macintosh) कंप्यूटर भी हैं। सभी सॉफ्टवेयर के लाइसेंस का प्रारूप इन सिस्टम पर उपलब्ध हैं और डेटा डाउनलोड व विश्लेषण के लिए नियंत्रण कंप्यूटरों (control computers) से नेटवर्क के माध्यम से जुड़े हुए हैं।
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